海淀区食品经营许可证超市、便利店疑难解析如下：
申请流程：
（1）填写《食品经营许可证申请表》，表中需要提供食品经营的类型、经营范围、地址、联系方式等信息。
（2）准备相关资料，包括但不限于营业执照、食品经营许可证的申请人的证件信息（身份证、营业执照等）、环保和消防证明、食品安全管理制度、相关设施和设备证明等。
（3）提交申请，等待相关部门进行审核。
（4）资料审核通过后，相关部门会进行现场检查，检查合格后颁发食品经营许可证。
疑难解析：
（1）对于申请材料不全或不符合要求的问题，需要按照许可证申请材料清单准备完整、符合要求的材料。
（2）对于无场所或场所不符合要求的问题，需要提供符合要求的经营场所，如无场所或场所不符合要求则需重新选址或进行整改。
（3）对于食品安全管理制度不健全的问题，需要建立完善的食品安全管理制度，包括食品采购、储存、加工、销售等环节的管理制度。
（4）对于从业人员未取得健康证明的问题，需要到指定机构进行体检并取得健康证明。
（5）对于无消防验收合格证明或不合格的问题，需要进行消防验收并取得合格证明，如不合格则需进行整改直至合格。
（6）对于无许可证或许可证过期、无效的问题，需要重新申请或更换许可证。
以上信息仅供参考，如有其他疑问，可以咨询海淀区相关或机构以获取准确信息。
