1、联次不同，增值税专用发票有四联，增值税普通发票只有三联。
2、发票使用人不同，增值税专用发票一般只能由增值税一般纳税人领购使用，普通发票由从事经营活动并办理了税务登记的各种纳税人使用。
3、内容不同，普通发票中没有关于增值税方面的内容。
4、作用不同，增值税专用发票可以抵扣进项税，而增值税普通发票不能。
增值税专用发票必须按下列规定开具：
1、项目填写齐全，全部联次一次填开，上、下联的内容和金额一致。
2、字迹清楚，不得涂改。如填写有误，应另行开具专用发票，并在误填的专用发票上注明“误填作废”四字。如专用发票开具后因购货方不索取而成为废票的，也应按填写有误办理。
3、发票联和抵扣联加盖单位发票专用章，不得加盖其他财务印章。根据不同版本的专用发票，财务专用章或发票专用章分别加盖在专用发票的左下角或右下角，覆盖“开票单位”一栏。发票专用章使用红色印泥。
