生态河道治理是指在河道陆域控制线内，在满足防洪、
排涝及引水等河道基本功能的基础上，通过人工修复措施促进河道水生态系统恢复，构建完整、健康、稳定的河道水生态系统的活动。河道是城市的基础设施中必不可少的一部分，其质量与城市经济的发展和人民的日常生活都有着极为密切的关系。
随着我国城市化建设速度的加快，为了提高城市的品味，加快城市经济的发展，相关部门将水环境的建设当成了一项重要的举措。目前，我国在河道的治理工作中依旧存在着一些问题，这些问题均对我国生态环境的健康发展造成了不良的影响，因此，对生态河道治理进行刻不容缓。
1.河道中的淤积比较严重
一般情况下，城市中的河道淤泥主要来自于建筑泥浆、河道淤泥、阴沟泥和污水处理厂污泥等。由于含有大量的病原菌、寄生虫（卵）、重金属及某些难降解的有机毒物，若处置不当，则会对环境造成二次污染。河道中出现较多的淤泥后，尤其是在河道的下游，河道中如果出现了过多的淤泥，就会加重对水体的污染。因此，河道的淤泥给百姓的生命安全以及财产安全均造成了严重的影响。
2.河道水面的面积没有受到保护
目前，很多地方的生态河道由于受到了各项建筑工程以及农民圈占等行为的影响，导致更多的建筑物和垃圾都被倒入了河道，这对河道水面的面积造成了一定的影响，使河道的截面积越来越小，导致其面积越来越小，不但减小了河道的容量，还影响了河道的正常使用功能。
3.河道沿岸的保护措施没有做到位
河道在长期的发展中，其自然特征也就发生了一些变化，传统的河道沿岸的保护措施中，将重点放在了水对河道的冲刷、水土保持等因素，所以说，其保护河道沿岸的传统结构形式也只有浆砌石、干砌块石、混凝土、预制混凝土块体、钢筋格宾笼等，而这些保护措施都是比较单一的，并且也破坏了各种植物以及微生物的生长环境，这也违背了现代社会对生态环境的要求。
与此同时，还严重地影响到了水流的生态功能以及周边植物的景观功能。目前，有很多城市在进行河道治理时，都重点追求的是河岸的硬化覆盖，这种方式只是比较片面的强调了防洪功能，导致河道的形态出现了单一化，而将河道的生态功能放在了次要的位置上，破坏了流动的生态链，使生态环境变得越来越糟糕。加上在此过程中对水质造成的严重污染，防洪能力逐渐减弱等都是我国当前河道工程治理中存在的问题。