招商加盟企业如果不进行商业特许经营备案，可能会面临一系列不利影响和潜在风险。
首先，不进行备案将违反《商业特许经营管理条例》的强制性管理标准。按照条例规定，特许人未在规定时间内向商务主管部门备案的，将受到商务主管部门的处罚，包括责令限期备案和罚款。逾期仍不备案的，将面临更严厉的罚款，并可能受到公告。这种处罚不仅会给企业带来经济上的损失，还可能损害企业的形象和声誉。
其次，未备案的特许经营企业在招商过程中可能面临信任危机。加盟商在选择合作对象时，往往会倾向于选择已经备案的、具备合法性和规范性的企业。如果企业未进行备案，加盟商可能会对其招商资格和特许经营能力产生质疑，从而影响企业的招商效果和业务发展。
此外，未备案的企业还可能面临法律风险和经营不确定性。由于未履行备案义务，企业可能更容易受到相关行政管理部门、行政执法机关以及司法机关的关注。在发生纠纷或涉及法律诉讼时，未备案的企业可能处于不利地位，需要承担更大的法律责任和风险。
综上所述，招商加盟企业进行商业特许经营备案是非常必要的。通过备案，企业可以展示自己的合法性和规范性，增强加盟商的信任度，降低法律风险和经营不确定性。因此，建议招商加盟企业尽早进行备案，以确保企业的合规经营和稳健发展。
