通用航空企业经营许可证的办理机构为中国民用航空局和各地区民航管理部门。具体来说，企业可以根据自身情况和所在地，选择向中国民用航空局或所在地区的民航管理部门提出申请。
在办理通用航空企业经营许可证之前，企业需要了解相关法规和标准，并确保自身符合相关条件。具体来说，企业需要拥有健全的组织机构和相应的航空知识，拥有符合要求的航空器和设施设备，并通过相应的技术检查。此外，企业还需要具备良好的财务状况、技术实力、服务质量、信誉等方面的综合实力。
在满足条件的基础上，企业需要准备相应的申请材料，包括通用航空经营许可证申请书、企业法人营业执照、税务登记证明、企业章程、机构设置和人员配置情况说明、法定代表人、主要经营管理人员的简历和资格证明文件、飞行器拥有和租赁协议，以及飞行器的相关技术资料等。
准备好申请材料后，企业可以将申请材料提交给中国民用航空局或所在地区的民航管理部门进行审核。审核通过后，将进入公示期，期间如无异议，公示期结束后可获得通用航空经营许可证。
需要注意的是，在办理通用航空企业经营许可证的过程中，企业需要遵守相关法规和标准，确保申请材料的真实性和准确性。同时，企业还需要注意一些常见的问题，如材料准备不充分、虚假申报等。这些问题可能会导致申请被驳回或延迟处理。
总之，通用航空企业经营许可证是从事通用航空经营活动的重要资质，它的办理机构为中国民用航空局和各地区民航管理部门。在办理过程中，企业需要严格遵守相关法规和标准，确保申请材料的真实性和准确性。
