卫生填埋技术一般作为其它技术的配套终处理手段，很少单独使用。高温焚烧法适用于各类医疗废物，焚烧后废物体积和重量明显减少，消毒灭菌及污染物去除效果好，且技术成熟；但建设和运行成本很高，会产生二噁英等剧毒物质及其它有害气体。高压蒸汽灭菌法投资低、操作费用低、残留物危险性较低；但易产生恶臭、可能有空气污染排放，并且必须对医疗废物进行破碎处理至小于50mm的尺寸。化学消毒法分干式和湿式，其工艺设备和操作简单方便，除臭效果好，消毒过程迅速，其中干式需要配合破碎处理一起使用，而湿式则会有废液和废气生成。
目前，全国261个大中城市均建立了自己的医疗废物处置中，实现了对本地区医疗废物的集中处置。其中140多家处置中心采用高温焚烧法，120多家处置中心采用高压蒸汽灭菌法，其它微波消毒、干化学和热解法各有几家。值得注意的是高压蒸汽灭菌法的市场比例仍然在增长。
微波消毒处理法
微波消毒技术是一种新型的医疗废物处理技术，但是目前仍于小批量、间歇式的处理医疗废物，不能满足大批量、连续式处理医疗废物的要求。
干热粉碎技术、辐照技术、等离子体法和电弧炉技术在实际应用中十分罕见，本文不做详细介绍。