个体工商户在民法上属于自然人的特殊状态，个体工商户不属组织，个体工商户的经营者对经营中的债务承担无限责任。
我国《公司法》允许设立的公司包括有限责任公司和股份有限公司。其中，一人有限责任公司，即，只有一个自然人股东或者一个法人股东的有限责任公司。依法成立的公司，具备法人资格。公司的股东或者发起人，只要按照公司章程出资到位，没有虚假出资、抽逃出资问题，一旦该公司本身资不抵债，其股东也仅以其出资为限对公司债务承担责任（也就是说，只要股东出资到位，且与公司不存在资产或者人格混同，就无需对公司债务另行承担责任）。
在所得税税收方面，公司如果有应纳税利润额，公司本身要缴纳企业所得税；在此基础上，公司向股东分红的，股东要按照其分红所得额缴纳个人所得税。即，双重缴纳所得税。但个体工商户本身是自然人的特殊状态，个体工商户营业所得，与该个人其他应纳税所得额一并计缴个人所得税，不会出现双重缴纳所得税问题。
在营业税、增值税方面，如果有限责任公司规模小，就与个体工商户一样，只要其月销售额（月营业额）未超过3万元，就免征增值税（营业税）。
在年度报告等方面，个体工商户还是更为简便。 另外，对于化学危险品经营等行业，现行法律行政法规明确不允许采取个体工商户形式，而需采取企业形式。如，按照《邮政法》，从事快递经营的，必须具备企业法人资格，那就应当办理公司登记，而不能申办个体工商户营业执照。
