申请互联网药品信息服务资格证书需要准备以下材料：
1. 申请表格：互联网药品信息服务资格证书申请表格，需填写真实、准确的信息。
2. 营业执照：申请单位的营业执照，需加盖公章。
3. 法人代表身份证明：申请单位法定代表人的身份证明，如身份证、护照等。
4. 负责人身份证明：申请单位负责人的身份证明，如身份证、护照等。
5. 药品经营许可证：申请单位的药品经营许可证，需加盖公章。
6. 网站备案信息：申请单位网站的备案信息，需加盖公章。
7. 网站安全保障措施：申请单位网站的安全保障措施，如防火墙、加密等。
8. 药品信息发布规则：申请单位制定的药品信息发布规则，需加盖公章。
9. 服务协议：申请单位与用户之间签订的服务协议，需加盖公章。
以上是申请互联网药品信息服务资格证书所需的材料清单，申请人应认真准备，并确保提供的材料真实、准确、完整。
