如果深圳公司的税务有异常，建议您按照以下步骤进行处理：
根据异常情况核实原因：如果是纳税申报出现错误，可以找财务人员认真检查纳税信息是否准确；如果是涉嫌逃税或者违法行为，需要尽快咨询专业的税务机构或律师，并向税务部门报备。
及时补正缴纳：核实出问题后，应及时补正缴纳税款。如有多年积案未处理的缴税问题，还可主动与税务局谈判制定还税计划，避免遭受罚款或其他****。
积极配合税务部门调查：税务局可能会要求企业提供更多的资料和信息，以便对问题进行查明。在此过程中，务必积极配合物务局的调查工作，尽可能配合、协商和协作。
深圳税务处罚疑难异常处理注销寻求专业帮助：如果对税务处理不熟悉，可以寻求专业的会计师事务所或税务律师等专业帮助，以确保正确地进行处理。
总之，对于深圳公司发现税务异常，一定要及时解决，以免影响企业正常运营和造成不必要的法律后果。
积极沟通，减少损失
深圳税务稽查需要严格对待，在与税务工作人员对接的时候，除了要对自家公司的情况了解外，在税收的政策、法律基础也要有一定的掌握，保持有效沟通，可以通过采取自查的方式补交相应的税额，避免或者减少可能产生的罚款和滞纳金。因此，当公司遇到税务稽查，各位老板应积极配合应对税务稽查，具体的应对方法如下：
1. 如果公司遇到的是被协查，那么一般是上游发票发票出了问题，比如购买的发票。这个别慌，一般不会涉及刑事问题，无非是补税多少的问题，当然了，金额特别大除外。
这个时候，我们就该迅速将非正常来源的发票移出，调整账务，在账务调整好之后，一定要和税局人员坦白来源，争取达到如下几个目的：争取避免被追究刑事责任；减少对正常生产经营的不良影响；避免其他不必要的经济损失。
2. 如果公司遇到的是被稽查，那么在正常情况下，税局是肯定掌握了你们公司有偷税漏税或者虚开发票等事情的证据，这个时候，该交代的及时交代，不该交代的也及时交代，争取达到如下目的：尽量争取减少涉案税款；尽量争取减少涉案罚款；尽量争取减少涉案滞纳金等等。
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