底质恶化的主要危害
导致大量有毒有害物质产生
池塘底部过多有机物在兼性厌*菌的发酵会产生大量有毒有害物质，如如氨、甲烷、有机酸、低级胺类、硫醇等，这些物质大都对水产养殖动物有着不同程度的毒害作用，容易引起鱼类免疫系统紊乱或是正常代谢受阻。
导致底部病原菌大量滋生造成池塘疾病爆发
池塘底泥本就是一些寄*虫和条件致病菌的的温床，一旦底质恶化，这些寄*虫及致病菌就会趁机大量繁殖，当数量达到致病数量时，而酸化的底部也会使一些体质弱的鱼群抵抗力下降，最终引发池塘疾病。
底质对水质的影响
养殖水体的底质包括与水接触的土壤和淤泥两部分。淤泥是由生物**、残剩饵料、粪便、各种有机碎屑以及各种无机盐、泥土沉积物等组成，因此，淤泥中含有大量的营养物质，包括有机质、氮、磷、钾、钙等。它们通过*菌的分解和离子交换作用，源源不断地向水中溶解和释放，为饵料生物的繁殖提供养分，或为养殖动物补充营养。淤泥中存在的胶体物质又能吸附大量的有机物质和无机盐，使施肥后的水不致于变得过肥，而当水中营养物质降低时，又可通过分解释放到水中。淤泥中存在大量的*菌，在淤泥表层一般是好气性*菌占优势，在淤泥底层由于氧气缺乏，则以嫌气性*菌占优势。
淤泥中的营养物质又是病原菌的培养基，病原菌在其中大量繁殖。同时淤泥又常成为***抗拒不利环境的避难所。淤泥过多，水中有机质也多，易使水质恶化，酸性增加，导致病菌大量繁殖。大量的淤泥沉积，其有害因素超过有利因素。
无论“生物型底改”还是“化学氧化型底改”，他们改良底质的核心原理都是一样的：
“生物型底改”是通过微生物之间的竞争关系来抑制池底的有害**，而“化学型底改”则是通过氧化的方式直接杀灭有害菌，效果更佳快速彻底。前者在发挥作用时要消耗大量的氧气，而后者不仅不耗氧有点产品还能释放氧气，解决池塘底部的氧债问题。
到了养殖中后期随着残饵、粪便和生物量的不断增多，“生物型底改”产品效果往往不理想。只有氧化型底改才能承受如此高的养殖负荷。