不同类型仓库的功能有所差异，若按仓储系统的信息管理来分，但都包含了如下四个基本子系统：入库子系统、仓储子系统、装卸搬运子系统、出库子系统。若按功能区域划分，可划分成储货区、入库区、出库区和管理区。对于配送中心的附属仓库还有相应的信息子系统、货物分拣子系统和专用的分拣区。
一、入库子系统
该系统时仓储作业的缓冲区，承担着货物的接运、货物的验收以及办理入库手续、并将到库货物按储存要求拆开包装，组成新的存储单元，如托盘、包装或容器，并完成有关信息的登录等一系列活动。货物接运的主要任务是及时准确地从交通运输部门提取入库物质；货物验收的主要任务是核对证件、实物检验合入库登记。
二、仓储子系统
该系统的任务是做好货位的管理工作及仓储物品的养护工作，如防虫、防鼠害作业、防腐作业、防锈蚀作业、防老化、防变质作业合仓储中的安全工作，保证仓储物品不受环境影响，使其本身的物理、化学、生物性能不发生变化。
货物在仓库内的存入合堆码方式一般有自身堆码、托盘堆码合货架存放三种方式：
三、装卸搬运子系统
该系统包括货物的入库、出库机械系统及货架（货垛）堆取作业机械系统。若无特殊要求，可将出入库机械系统合为一体。货物的运输可以采用人力驱动，也可采用半自动或全自动的方式，借助辊道输送机、链式输送机、叉车、堆垛机，辅以行车、手推车、电瓶搬运车完成货物的出入
四、出库子系统
货物的出库、发运是储存过程的终止，也是仓库作业的最后一个环节。该系统承担着整理、包装出库物资，核对出货凭证并登帐及向承运机构点交货物。物出库时，一般遵循“先进先出”的原则，对有效期限的货物要在限期内发放完毕；对于采用自身堆码和托盘堆码方式的仓库，也可采用“后进先出”的方式；对多品种小批量的货物出库可以采用拣选出库。
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